luisito2
Madmaxista
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La proteína no tiene estructura cristalina. Cristalizan artificialmente la proteína en el laboratorio, con suerte, para estudiarla.
Esta es una consecuencia de la limitación de la potencia de cálculo de los ordenadores. La composición química de una proteína puede conocerse con precisión absoluta. Una proteína está formada por una ristra de componentes básicos, uno tras otro, como las cuentas de un collar. La secuencia concreta de aminoácidos que formar una proteína concreta deriva directamente de la secuencia genética en el ADN del gen que contiene la receta de fabricación de esa proteína.
Las proteínas con máquinas químicas o piezas de máquinas químicas y la secuencia de aminoácidos que forman una proteína contiene la información necesaria para dar forma tridimensional a cada proteína. Los sistemas de análisis de proteínas, la 'secuenciación' de una proteína, ven la proteína como una larga ristra de aminoácidos uno tras otro pero la proteína funcional está compactada y tiene cierta forma. Esto es análogo a cómo un solo hilo de Aluminio, cuando se pliega lo suficiente, se convierte en un estropajo de Aluminio con una forma dada.
Este 'plegamiento' de la ristra lineal hasta convertir la proteína en un objeto tridimensional es determinista: la información que determina el plegamiento está contenida en la secuencia de aminoácidos y en la secuencia del gen que contiene las instrucciones de fabricación de la proteína.
Lamentablemente, los super-ordenadores son incapaces de deducir qué forma tendrá una proteína terminada a pesar de que se conoce con precisión la secuencia de la proteína y de que esa secuencia contiene toda la información necesaria para producir, de forma determinista, ese plegamiento. Es un caso análogo al de la imposibilidad del cálculo económico: aunque un mercado puede resolver el cálculo económico y cualquier bacteria resolver el plegamiento de una proteína a partir de su secuencia, ningún ordenador puede resolver esa simulación por falta de potencia de cálculo.
Incapaces de resolver deterministamente el problema, aunque tienen todos los datos, solo pueden conocer la forma terminada de la proteína por medio de un método Paco: la cristalografía de Rayos X
Este proceso requiere cristalizar la proteína que se investiga, o sea, empaquetar juntas y de manera ordenada, millones de copias idénticas de la proteína en cuestión. Este es un proceso que requiere mucho arte y suerte.
Una vez que se dispone del cristal, se ilumina desde disferentes ángulos con fotones (de Rayos X) y se analiza los patrones de difracción en los rayos X. A partir de esos patrones, y con mucho arte y suerte, se deduce la forma de la proteína funcional.
Ejemplo de patrón de difracción.
