Nunca es bueno tragarte esas cosas pero el ácido de tu estómago acaba con ellas casi con completa seguridad. No siempre con todos los seres pero los grandes no suelen tener posibilidades de infección gastrointestinal. Si me hablases de amebas, bacterias y demás (que no verías sin microscopio) la cosa ya sería diferente y como mínimo te causarían diarreas.
A ver si esto te sirve de ayuda pero, vamos, yo que tú estaría tranquilísimo a no ser que empezases a sentir síntomas de que algo va mal en tu cuerpo:
Estas son las 10 principales enfermedades transmitidas por el agua, a través de bichito y bacterias que pueden causar trastornos más o menos graves.
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Edito: si cocieses ese agua hasta el punto de ebullición ya la tranquilidad sería completa porque no sería de esperar que ese agua de manantial o fuente que viene del monte sin industrias por medio contuviera metales pesados y demás.