Estimaciones de la gravedad y la transmisibilidad de la nueva variante 501Y.V2 del SARS-CoV-2 de Sudáfrica
Estado: artículo en revisión por pares
El 18 de diciembre de 2020, los investigadores informaron sobre la aparición de una nueva variante del SARS-CoV-2, 501Y.V2, en Sudáfrica. Esto coincidió con una incidencia acelerada de casos de el bichito-19, a pesar de que la esa época en el 2020 de la que yo le hablo cambió a principios de año bajo controles relajantes de salud pública, consistente con la dinámica que refleja una acumulación sustancial de inmunidad (Figura 1A-B). 501Y.V2 pronto se detectó en otros países con probable conexión con viajeros de Sudáfrica. Otra variante de rápida propagación parece haber surgido de forma independiente en el Reino Unido, estimada en 1,56 (intervalo creíble del 95% (CrI): 1,50-1,74) tan transmisible como los linajes que circulaban anteriormente. Al igual que con la variante del Reino Unido, existe una necesidad urgente de caracterizar la transmisibilidad y gravedad de 501Y.V2.
Utilizando los datos disponibles a nivel mundial, calibramos un marco de modelado del SARS-CoV-2 para la esa época en el 2020 de la que yo le hablo sudafricana y evaluamos la nueva variante para detectar un posible aumento de la transmisibilidad o el escape inmunológico. Suponiendo una protección cruzada completa, estimamos que 501Y.V2 es 1,50 (95% CrI: 1,20-2,13) veces más transmisible que las variantes que circulaban anteriormente. Suponiendo en cambio que 501Y.V2 es idénticamente transmisible, la nueva variante evade el 21% (95% CrI: 11-36%) de la inmunidad adquirida previamente. La realidad puede encontrarse entre estos extremos, con un aumento intermedio de la transmisibilidad y una protección cruzada levemente imperfecta de exposiciones pasadas. Aunque nuestro análisis no identifica en qué parte de este espectro se encuentra 501Y.V2, toda la gama tiene graves consecuencias para la salud pública.
Encontramos alguna evidencia de un cambio en la gravedad (Figura 1C), estimada a partir de la proporción corregida de casos ajustados por demora y muertes en la provincia de Western Cape, aunque existe una incertidumbre sustancial y las demoras en los informes locales pueden diferir de las estimaciones globales. Es esencial el monitoreo continuo de la gravedad, incluida una investigación más detallada de las diferencias en los informes, la incidencia en nuevos grupos demográficos o el hacinamiento del sistema de salud.
La aparición de dos variantes novedosas en el Reino Unido y Sudáfrica con un aumento de transmisibilidad estimado similar sugiere que habrá desafíos sustanciales con el control global del SARS-CoV-2 a principios de 2021. Esto destaca la necesidad de mantener las medidas de control y acelerar la implementación de la vacunación , así como un seguimiento continuo de la eficacia de la banderilla contra nuevas variantes para detectar rápidamente el escape inmunológico.
https://cmmid.github.io/topics/cobi19/figures/sa_novel_variant_Figure1.png
Figura 1.En todos los paneles, las cintas representan intervalos creíbles del 95% (más claro) y 50% (más oscuro). R: Dinámica informada y proyectada de casos a lo largo del tiempo en Sudáfrica, con la aparición estimada de 501Y.V2 superpuesta. Los casos modelo se ajustan mediante una tasa de verificación calculada para ajustarse a la incidencia estable en septiembre y las muertes en un 50%. Para los casos, el modelo sugiere que la verificación es del 3% (95% CrI: 1-24%). B: Fracción de ataque acumulada proyectada del modelo de muestra, por grupos de edad; retícula de la encuesta serológica de la población centinela (personas que viven con el VIH y mujeres embarazadas). Los datos de la encuesta serológica no se utilizaron en la calibración. C: Índice de letalidad de casos calculado utilizando series de tiempo diarias de nuevos casos notificados y nuevas muertes por el bichito-19 en la provincia de Western Cape en Sudáfrica, con la serie temporal de muertes corregida por el retraso entre la confirmación y la muerte. El Cabo Occidental tiene la serie temporal de muertes más consistente, basada en la comparación con el exceso de muertes y, por lo tanto, es probablemente el indicador más preciso. El CFR corregido para cada provincia y toda Sudáfrica se muestra en la Figura 3 del Apéndice.
Estimates of severity and transmissibility of novel South Africa SARS-CoV-2 variant 501Y.V2
