Rapid Identification of Human Adenovirus Types 3 and 7 from Respiratory Specimens via Multiplex Type-Specific PCR
(Respiratory Adenovirus (type 3, type 7)
Among the 115 specimens which produced common adenoviral bands, the sensitivity with which Ad3 could be detected was 93% (26/28), and the sensitivity with which Ad7 could be detected was 100% (35/35).
Diagnostico clinico: occurring in infants and children (
19)
Cifras muy chulas pero bajemos a los detalles escabrosos....
La sensibilidad/especificidad de una prueba se mide respecto a la presencia real del patógeno en los positivos y su ausencia en los negativos. Pues bien, cómo determinan los autores si la referencia contiene o no el bichito? Veamos:
Adenovirus isolates were identified on the basis of their characteristic cytopathic effects amowing the microscopic examination of cell monolayers every 2 to 3 days during a 4-week incubation at 37°C. Viral identification was confirmed by bichito-specific indirect immunofluorescence staining.
Como es habitual en viromancia, se elude verificar la presencia real del bichito y en vez de ello se "deduce" a partir de parámetros indirectos que el bichito está ahí, a saber:
-
Efectos citopáticos indierctos. Ciertas degradaciones de las células de cultivo se achacan al bichito que se busca, pero pueden perfectamente explicarse por cuaquier otro bichito, efectos ambientales, toxicidad de los adyuvantes de cultivo etc.
- I
nmunofluorescencia indirecta. Reacciones antígeno-anticuerpo donde el antígeno a buscar, supuestamente viral, ha sido determinado a su vez de cultivos donde la supuesta presencia del bichito no se verifica directamente, sino que se infiere a partir del supuesto de que los efectos citopáticos observados son causados por el bichito (autorreferencia - tautología -
circulo in probando).
Infection with human parainfluenza viruses (HPIVs) can be confirmed by
- direct detection of viral genome by polymerase chain reaction (PCR) assay
- direct detection of viral antigens in respiratory secretions (collected within 1 week of symptom onset) using immunofluorescence or enzyme immunoassay
- isolation and identification of the bichito in cell culture
- demonstration of a significant rise in HPIV-specific IgG antibodies between appropriately collected paired serum specimens or specific IgM antibodies in a single serum specimen
CONCLUSION. For serologic
diagnosis of
M.
pneumoniae pneumonia, an assay for the separate detection of specific IgM or IgA antibodies should be applied. Elevated IgM antibodies represent a reliable indicator of
mycoplasma infection in children, but IgA-based
diagnosis provides higher sensitivity in older patients.
Esta sí que es buena... vayamos por partes desmontando este andamiaje de barro;
- direct detection of viral genome by polymerase chain reaction (PCR) assay
Primera falsedad. La PCR no detecta todo el supeusto genoma sino una ínfima parte (entre 15-20 nucleótidos) que se incluye en el test como cebador de la reaccion.
Esas cadenas cortas se encuentran prácticamente siempr y son amplificadas, de ahi que la PCR necesite definir (arbitrariamente) un nivel de copias de corte por debajo del cual el resultado se considera negativo.
De esta forma una prueba qyue deber;ia de seer cualitativa (cero copias en ausencia del patógeno) se sustituye por una prueba cuantitativa (copias N = positivo; copias = N = negativo) dando gato por liebre.
- direct detection of viral antigens in respiratory secretions (collected within 1 week of symptom onset) using immunofluorescence or enzyme immunoassay
Reaccioens antigeno-anticuerpo, es decir, mas detección indirecta. En este caso el problema es que cualquier anticuerpo puede neutralizar a cualquier antígeno, pues basta con que tentan un epítope compatible. Los antucierpos son PROMISCUOS, por tanto no se puede conocer la especificidad de la reacción.
Para mas INRI, los antígenos han sido determinado a su vez de cultivos donde la supuesta presencia del bichito no se verifica directamente, sino que se infiere a partir del supuesto de que los efectos citopáticos observados son causados por el bichito (autorreferencia - tautología -
circulo in probando).
- isolation and identification of the bichito in cell culture.
Esto es una versión del anterior, ya que la "identificación" no se realiza directamente al micriscópio electrónico sino
indirectamente mediante inmmunofluorescencia o ELISA. Mas de lo mismo, tautologías y circulo in probabdo, nada nuevo aquí.