Supongamos que quieres pasar un dinero de la entidad A a la entidad B.
Si lo haces mediante transferencia, te presentas en la entidad A y les dices que envíen el dinero a la entidad B.
Si lo haces mediante OTE, te presentas en la entidad B y les dices que le reclamen el dinero a la entidad A.
Esa es la gran diferencia: que en un caso lo gestionas con la entidad de origen y en el otro, con la de destino.
Aparte de esto, las transferencias suelen conllevar comisión y las OTE normalmente son gratuitas. También son algo más lentas; pueden tardar cuatro o cinco días en hacerse efectivas. Y, claro, para hacer una OTE tienes que ser titular de ambas cuentas.
Saludos.