Bueno, supongo que la mayoría seguira los protocolos y estandares de IOTA porque así no tendrán que invertir en desarrollo y podrán comunicarse con el resto del mundo, al igual que usamos los protocolos de Internet estandares, lo que no quita que cualquiera se pueda crear los suyos propios.
Lo puedes hacer pero si nadie lo usa no sirve para nada, necesitas que los demás que se unan a tu red confien en ti y que ademas quieran usarla, si los fabricantes como DELL, Intel, Nordic, Toyota, Fujitsu usan la red de IOTA y tu tienes una empresa de peaje de autovias logicamente querras estar en la red de IOTA, no en una nueva que no la usa nadie, digo yo.
En cambio para tu empresa, internamente podrías hacerlo para tus empleados pero si quieres conectarlo fuera de ahi tendrás que usar alguna de confianza.