USA se está poniendo las pilas para detectar la nueva cepa UK, otra cosa luego son las medidas que deberían acompañar.
La cepa UK nos va a pasar como un vendaval por encima.
De nuevo, como e insistido en otras asuntos relacionados con esto, la logística no está preparada y las personas que gestionan no están preparadas.
Se necesita agilidad, rápidez de pensamiento y acciones inmediatas.
Tristemente no hay mucha gente así, no queda mucha gente así.....un ejemplo fue el Mando de Policía Nacional que destituyeron por avisar de la que venía.
No tenemos formación practica en gestión de emergencias reales.
En lo que se redacta un decreto el bichito arrasa una residencia.
Hay que juntar matemáticos ágiles, estadísticos, jugadores de ajedrez, mandos medios de bomberos, hasta un quarteeback de NFL sirve, gente de urgencias, y otros de profesiones que deben tomar decisiones inmediatas, un político no sirve.
Lo vemos con las banderillas, lo dijimos, lo dijimos con la jeringas, con las mask ( avisásteis otros), con pulsis etc....
Ahora pasará con las PCR para la nueva cepa......No sirven el 90%, no detectan, y con lo test antígenos igual.
No valdrá un PCR normal para detectar. Aquí demuestro porqué.
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¿Qué es SGTF y por qué es importante?
En primer lugar, informamos sobre la posible propagación de la variante B.1.1.7 en los Estados Unidos en función de la aparición de la pérdida del gen S, un fenómeno en el que la prueba qRT-PCR no detecta la presencia del gen S del bichito debido a una deleción mutación que afecta a los aminoácidos H69 y V70 (esto también se conoce como falla de la diana del gen S o SGTF). Esta deleción es una de varias mutaciones que distinguen a B.1.1.7 de otras cepas de SARS-CoV-2. En estos casos, la prueba qRT-PCR aún puede identificar la presencia del bichito gracias a otros dos objetivos en el bichito: el gen N y el gen ORF1.
El análisis posterior de la secuencia viral de las muestras de SGTF utilizando la prueba COVIDSeq de Illumina confirmó que solo un subconjunto de estas muestras albergaba todas las variantes que definen B.1.1.7. Las restantes muestras de SGTF eran otras variantes del bichito. Hemos asignado cada una de las secuencias SGTF a un clado filogenético para comprender la evolución reciente de este bichito.
Para monitorear las tendencias en la transmisión B.1.1.7, así como la dinámica de otras variantes que albergan la deleción H69 / V70, continuaremos secuenciando regularmente muestras de SGTF de alta calidad con el gen N Cq <27 * de nuestro laboratorio y las colocaremos cepas de la filogenia del SARS-CoV-2. Mientras creciente en la prevalencia, las muestras SGTF representan un pequeño subconjunto de todos Helix positivos ® el bichito-19 Resultados de la prueba. También estamos expandiendo este programa de vigilancia más allá de las muestras de SGTF para monitorear de manera proactiva la aparición y propagación de nuevas variantes.
Los paneles interactivos que se proporcionan arriba y abajo se actualizan semanalmente. El panel anterior sirve para resaltar específicamente los casos B.1.1.7 en los EE. UU.
* Cq está definido por las directrices de Información mínima para la publicación de experimentos cuantitativos de PCR en tiempo real (MIQE) como ciclo de cuantificación y es equivalente al umbral de cuantificación (Ct)
Limitaciones
- Siguiendo un enfoque conservador, solo analizamos muestras positivas con una fuerte amplificación del gen N (Ct <27), y muestras abandonadas sin absolutamente ningún gen S detectado. Debido a que algunas muestras pueden tener un título viral más bajo y, por lo tanto, dar como resultado una señal de amplificación más débil, no estamos analizando todas las muestras positivas aquí. Por lo tanto, la fracción final de SGTF puede diferir ligeramente.
- Dado que las muestras no se identifican antes del análisis, y algunos individuos pueden realizar la prueba más de una vez, puede haber algunos individuos duplicados que podrían causar una desviación de la fracción de población real.
- Las pruebas por estado no reflejan la distribución de la población de los EE. UU. Y, por lo tanto, algunos estados sin abandono del gen S pueden ser falsos negativos.
Datos actuales USA cepa UK
The Helix el bichito-19 Surveillance Dashboard