Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations
Also present is the deletion of two amino acids at sites 69-70 in spike - this mutation is one of a number of recurrent deletions observed in the N terminal domain of Spike (McCarthy et al. 2020; Kemp et al. 2020) and has been seen in multiple lineages linked to several RBD mutations.
For example, it arose in the mink-associated outbreak in Denmark on the background of the Y453F RBD mutation, and in humans in association with the N439K RBD mutation, accounting for its relatively high frequency in the global genome data (~3000 sequences).
Dadas (i) las consecuencias fenotípicas plausibles y predichas experimentalmente de algunas de estas mutaciones, (ii) sus efectos desconocidos cuando están presentes en combinación, y (iii) la alta tasa de crecimiento de B.1.1.7 en el Reino Unido,
este nuevo linaje requiere una caracterización de laboratorio urgente y una vigilancia genómica mejorada en todo el mundo.
La cepa británica del cobi19 solo se puede detectar con una clase de PCR - Economía Digital
