Y de paso meten al pangolín en el medio... como posible intermediario
Resulta que según este estudio el ancestro del bichito es de murciélago y lleva circulando décadas,cosecha del 69
este bichito es creación de laboratorio,cultivado y adaptado durante mucho tiempo con afinidad al receptor ace2
LOS INVESTIGADORES IDENTIFICAN LOS ORÍGENES EVOLUTIVOS DEL SARS-COV-2
Al reconstruir la historia evolutiva del SARS-CoV-2, el bichito responsable de la esa época en el 2020 de la que yo le hablo de el bichito-19, un equipo internacional de investigación de científicos chinos, europeos y estadounidenses descubrió que el linaje que dio origen al bichito ha estado circulando en murciélagos durante décadas y probablemente incluye otros bichito con la capacidad de infectar a los humanos. Los hallazgos, a los que contribuyeron los científicos de la Universidad de Glasgow, tienen implicaciones para la prevención de futuras pandemias derivadas de este linaje.
"Los cobi19 tienen material genético que es altamente recombinante, lo que significa que diferentes regiones del genoma del bichito pueden derivarse de múltiples fuentes", dijo Maciej Boni, profesor asociado de biología, Penn State. “Esto ha dificultado la reconstrucción de los orígenes del SARS-CoV-2. Debe identificar todas las regiones que se han estado recombinando y rastrear sus historias. Para hacer eso, reunimos un equipo diverso con experiencia en recombinación, datación filogenética, muestreo de bichito y evolución molecular y viral ".
El equipo utilizó tres enfoques bioinformáticos diferentes para identificar y eliminar las regiones recombinantes dentro del genoma del SARS-CoV-2. Luego, reconstruyeron las historias filogenéticas de las regiones no recombinantes y las compararon entre sí para ver qué bichito específicos han estado involucrados en eventos de recombinación en el pasado. Pudieron reconstruir las relaciones evolutivas entre el SARS-CoV-2 y sus bichito más conocidos de murciélago y pangolín. Sus hallazgos aparecen hoy en Nature Microbiology.
Los investigadores descubrieron que el linaje de bichito al que pertenece el SARS-CoV-2 divergió de otros bichito de murciélago hace unos 40-70 años. Es importante destacar que, aunque el SARS-CoV-2 es genéticamente similar (alrededor del 96%) al cobi19 RaTG13, que se tomó de una muestra de un murciélago de herradura Rhinolophus affinis en 2013 en la provincia de Yunnan, China, el equipo descubrió que divergió de RaTG13 durante un tiempo relativamente largo Hace, en 1969.
"La capacidad de estimar los tiempos de divergencia después de desenredar los historiales de recombinación, que es algo que desarrollamos en esta colaboración, puede conducir a la comprensión de los orígenes de muchos patógenos virales diferentes", dijo Philippe Lemey, investigador principal del Departamento de Virología Evolutiva y Computacional, KE Leuven.
El equipo descubrió que uno de los rasgos más antiguos que el SARS-CoV-2 comparte con sus parientes es el dominio de unión al receptor (RBD) ubicado en la proteína Spike, que permite que el bichito reconozca y se una a los receptores en las superficies de las células humanas. .
"Esto significa que otros bichito que son capaces de infectar a los humanos están circulando en murciélagos de herradura en China", dijo David L. Robertson, profesor de virología computacional, Centro de Investigación de bichito de la Universidad de Glasgow de MRC.
¿Serán estos bichito capaces de saltar directamente de los murciélagos a los humanos o se requerirá una especie intermedia para dar el salto? Según Robertson, para el SARS-CoV-2, otros grupos de investigación propusieron incorrectamente que ocurrieron cambios evolutivos clave en los pangolines.
"La secuencia RBD del SARS-CoV-2 hasta ahora solo se ha encontrado en unos pocos bichito de pangolín", dijo Robertson. "Además, la otra característica clave que se cree que es instrumental para la capacidad del SARS-CoV-2 de infectar a los humanos, una inserción del sitio de escisión polibásica en la proteína Spike, aún no se ha visto en otro pariente cercano del bichito del SARS-CoV-2 . Sin embargo, si bien es posible que las pangolinas hayan actuado como un huésped intermedio que facilita la transmisión del SARS-CoV-2 a los humanos, no existe evidencia que sugiera que la infección por pangolín es un requisito para que los bichito de murciélago pasen a los humanos. En cambio, nuestra investigación sugiere que el SARS-CoV-2 probablemente evolucionó la capacidad de replicarse en el tracto respiratorio superior tanto de humanos como de pangolines ".
El equipo concluyó que la prevención de futuras pandemias requerirá un mejor muestreo dentro de los murciélagos salvajes y la implementación de sistemas de vigilancia de enfermedades humanas que puedan identificar nuevos patógenos en humanos y responder en tiempo real.
"La clave para una vigilancia exitosa", dijo Robertson, "es saber qué bichito buscar y priorizar aquellos que pueden infectar fácilmente a los humanos. Deberíamos haber estado mejor preparados para un segundo bichito del SARS ".
Boni agregó: “Tardamos demasiado en responder al brote inicial de SARS-CoV-2, pero esta no será nuestra última esa época en el 2020 de la que yo le hablo de cobi19. Se necesita un sistema de vigilancia mucho más completo y en tiempo real para capturar bichito como este cuando los números de casos todavía están en los dos dígitos ".
Otros autores en el documento incluyen: Xiaowei Jiang, profesor de bioinformática, Xi'an Jiaotong-Liverpool University; Tommy Tsan-Yuk Lam, profesor asistente de salud pública, Universidad de Hong Kong; Blair Perry, estudiante graduado, Universidad de Texas Arlington; y Todd Castoe, profesor asociado de biología, Universidad de Texas Arlington; y Andrew Rambaut, profesor de evolución molecular, Instituto de Biología Evolutiva, Universidad de Edimburgo.
El Consejo Europeo de Investigación, el Consejo de Investigación Médica, la Fundación de Investigación - Flandes y la Fundación Nacional de Ciencias Naturales de China brindaron apoyo para esta investigación.
University of Glasgow - University news - Researchers identify evolutionary origins of SARS-CoV-2
Orígenes evolutivos del linaje del sarbecovirus SARS-CoV-2 responsable de la esa época en el 2020 de la que yo le hablo de el bichito-19
Resumen
Hay preguntas evolutivas pendientes sobre la reciente aparición del cobi19 humano SARS-CoV-2, incluido el papel de las especies reservorio, el papel de la recombinación y su tiempo de divergencia de los bichito animales. Encontramos que los sarbecovirus, el subgénero viral que contiene SARS-CoV y SARS-CoV-2, sufren recombinación frecuente y exhiben diversidad genética estructurada espacialmente a escala regional en China. El SARS-CoV-2 en sí no es un recombinante de ningún sarbecovirus detectado hasta la fecha, y su motivo de unión al receptor, importante para la especificidad de los receptores ACE2 humanos, parece ser un rasgo ancestral compartido con los bichito de murciélago y no uno adquirido recientemente por recombinación. Para emplear métodos de datación filogenética, las regiones recombinantes de una alineación de sarbecovirus del genoma 68 se eliminaron con tres métodos independientes. Se demostró que las estimaciones de la tasa de evolución bayesiana y la fecha de divergencia son consistentes para estos tres enfoques y para dos especificaciones previas diferentes de tasas evolutivas basadas en HCoV-OC43 y MERS-CoV. Las fechas de divergencia entre el SARS-CoV-2 y el reservorio de sarbecovirus del murciélago se estimaron en 1948 (95% de densidad posterior más alta (HPD): 1879-1999), 1969 (95% HPD: 1930-2000) y 1982 (95% HPD: 1948 –2009), lo que indica que el linaje que dio lugar al SARS-CoV-2 ha estado circulando inadvertido en los murciélagos durante décadas.
Evolutionary origins of the SARS-CoV-2 sarbecovirus lineage responsible for the el bichito-19 pandemic