Las seis cepas de SARS-CoV-2
El virus que causa la pandemia de COVID-19, SARS-CoV-2, presenta al menos seis cepas. A pesar de sus mutaciones, el virus muestra poca variabilidad, y esta es una buena noticia para los investigadores que trabajan en una vacuna viable.
Estos son los resultados del estudio más extenso realizado sobre la secuenciación del SARS-CoV-2. Los investigadores de la Universidad de Bolonia se basaron en el análisis de 48,635 genomas de coronavirus, que fueron aislados por investigadores en laboratorios de todo el mundo. Este estudio fue publicado en la revista
Frontiers in Microbiology . Entonces fue posible para los investigadores mapear la propagación y las mutaciones del virus durante su viaje a todos los continentes.
Los primeros resultados son alentadores. El coronavirus presenta poca variabilidad, aproximadamente siete mutaciones por muestra. La gripe común tiene una tasa de variabilidad que es más del doble.
"El coronavirus SARS-CoV-2 presumiblemente ya está optimizado para afectar a los seres humanos, y esto explica su bajo cambio evolutivo", explica Federico Giorgi, investigador de Unibo y coordinador del estudio. "Esto significa que los tratamientos que estamos desarrollando, incluida una vacuna, podrían ser efectivos contra todas las cepas de virus".
Actualmente, hay seis cepas de coronavirus. La original es la cepa L, que apareció en Wuhan en diciembre de 2019. Su primera mutación, la cepa S, apareció a principios de 2020, mientras que, desde mediados de enero de 2020, hemos tenido cepas V y G. Hasta la fecha G es el más extendido: muta a las cepas GR y GH a fines de febrero de 2020.
"La cepa G y sus cepas relacionadas GR y GH son, con mucho, las más extendidas, representando el 74% de todas las secuencias de genes que analizamos", dice Giorgi. "Presentan cuatro mutaciones, dos de las cuales pueden cambiar la secuencia de la ARN polimerasa y las proteínas Spike del virus. Esta característica probablemente facilita la propagación del virus".
Si miramos el mapa de coronavirus, podemos ver que las cepas G y GR son las más frecuentes en Europa e Italia. Según los datos disponibles, la cepa de GH parece casi inexistente en Italia, mientras que ocurre con mayor frecuencia en Francia y Alemania. Esto parece confirmar la efectividad de los métodos de contención de los últimos meses.
En América del Norte, la cepa más extendida es la GH, mientras que en América del Sur encontramos la cepa GR con mayor frecuencia. En Asia, donde apareció inicialmente la cepa Wuhan L, la propagación de las cepas G, GH y GR está aumentando. Estas cepas llegaron a Asia solo a principios de marzo, más de un mes después de su propagación en Europa.
A nivel mundial, las cepas G, GH y GR están en constante aumento. La cepa S se puede encontrar en algunas áreas restringidas en los Estados Unidos y España. Las cepas L y V están desapareciendo gradualmente.
Además de estas seis cepas principales de coronavirus, los investigadores identificaron algunas mutaciones poco frecuentes que, por el momento, no son preocupantes, pero que, sin embargo, deben ser monitoreadas.
"Las mutaciones genómicas raras son menos del 1% de todos los genomas secuenciados", confirma Giorgi. "Sin embargo, es fundamental que los estudiemos y analicemos para poder identificar su función y monitorear su propagación. Todos los países deben contribuir a la causa al dar acceso a datos sobre las secuencias del genoma del virus".
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Este estudio fue publicado en la revista
Frontiers in Microbiology con el título "Distribución geográfica y genómica de mutaciones de SARS-CoV-2". Los autores son Daniele Mercatelli y Federico M. Giorgi, ambos del Departamento de Farmacia y Biotecnología de la Universidad de Bolonia.
The six strains of SARS-CoV-2
