Sin entrar en la BIOS no se puede. Tienes que configurarlo para que al apagar el ordenador no dé corriente al puerto USB, de otra forma se queda encendido siempre.
Si es uno de Mars Gaming o Genius, los "barateros" vamos, no te queda otra (y a veces ni así). Los de más calidad se desactivan al apagar el PC ellos solitos, sin tocar nada en la BIOS.