⚡⚡(HILO OFICIAL) : CRISIS DEL cobi19 ☣SARS-CoV2☣

El Tuerto

Será en Octubre
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Y les están poniendo a los brasileños la de Sinovac que solo protege el 50%? jorobarrrrr... toma placebo.
Pero uno de los requisitos de la agencia brasileña del medicamento, era que las pruebas previas se realizasen en Brasil y con brasileños, no con anónimos voluntarios o en un laboratorio de north Dakota, cosa que aceptaron los chinos y los de AstraZeneca.

Veremos.
 

Alvin Red

El antepenúltimo del floro
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El Tuerto

Será en Octubre
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Yo quiero creer...

Pero es que después de toneladas de mentiras y de hez por parte de los mismos que venden ahora la banderilla como el crecepelo milagroso, uno se vuelve escéptico y desconfiado.
 

Petancios

Himbersor
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Traigo hoy una pequeña chuletilla y aclaración respecto a tantas variantes, cepas y mutaciones coronavíricas. Entre tantos nombres y números durante meses no es difícil formarse un cacao mental; al menos en mi caso tengo que tirar de memoria, artículos y comentarios del foro para recordar si una variante era sinónimo de otra, o había venido de allí, o contenía tal mutación apocalíptica.

Además hago estos “pacoapuntes” para rectificar las veces que he usado indistintamente algunos términos como “cepa inglesa” “mutación tal cual”, etcétera, que si bien creo que la gran mayoría entiende a qué me refería, nunca está de más hablar con propiedad en este nuestro hilo. Y si sirve a foreros más expertos, miel sobre hojuelas. Que no se diga que no podemos revisarnos mutuamente xD. Por supuesto no es mi intención ponernos sibaritas ni imponer una gramática covicientífica, tan solo tener una guía de referencia y hacer más ameno (si es que se puede) todo este tema que nunca descansa.



Comienzo por un par de artículos que nos aclaran la terminología:

La complejidad de las nuevas variantes del cobi19

mutacionescepas.jpg

Cuando hablamos de variantes nos referimos a diferencias en la secuencia del genoma debidas a mutaciones. Cepa es una variante en la que se demuestran cambios en su biología (antigenicidad, transmisibilidad, virulencia, …). De momento, hablemos de variantes.

el bichito: Cuál es la diferencia entre mutaciones, variantes y una cepa de cobi19



En resumen: el término “cepa” no sería el más correcto cuando nos referimos a la inglesa, sudafricana, brasileña, japoleña…

Una cepa sería el propio SARS-CoV-2, otra el SARS-CoV-1. Dentro de cada cepa, tenemos clados, linajes o variantes, y por supuesto mutaciones por doquier.

CEPA: SARS-CoV-2


El siguiente nivel serían los clados, las “ramas” del árbol filogenético, que contienen un antepasado común y todos sus descendientes. Dentro de un clado encontraríamos linajes o variantes emparentadas.

En julio ya tuvimos un informe del Carlos III que nos hablaba sobre las diversas nomenclaturas y clados propuestos para el cobi19.

Hacían referencia al sistema de nomenclatura de la página Nextstrain, que por aquel entonces clasificaba cinco grandes clados:


19A, 19B, 20A, 20B, 20C

clados.PNG

Actualmente Nextstrain clasifica hasta el 20J, referido a la variante brasileña

Clado 20H/501Y.V2 (contiene la variante sudafricana)

Clado 20I/501Y.V1 (contiene la variante inglesa)

Clado 20J/501Y.V3 (contiene la variante brasileña)


En el siguiente artículo se nos habla de los clados que estuvieron circulando por España y Europa el pasado año:

Historia genómica del cobi19 en España, del enlace con Kazajistán al estigma de los temporeros

Más sobre los clados:

Genomic epidemiology of SARS-CoV-2 bichito with a bioinformatics platform

https://www.researchgate.net/profile/Sebastian_Iglesias-Osores/publication/343054408/figure/fig2/AS:914909957214208@1595142940396/Distribution-of-phylogenetically-generated-clades-of-the-SARS-CoV-2-bichito-across-the.png


Sin embargo confieso (de nuevo) que la nomenclatura de clados de Nextstrain se me hace un tanto engorrosa para distinguir rápidamente las variantes más populares en los medios. Por ello vamos al siguiente nivel, a los linajes/variantes.

Decir también que en muchos artículos se les llama a estos clados de Nexstrain variantes, como

“Variante VOC 202012/01 o 501Y.V1” lo que aumenta la confusión, así que dejemos los clados y vamos a por lo siguiente.

Aquí es donde comienza la “chicha” y la comidilla de conversaciones y burbumoris.

Ya comenté sobre los linajes que comenzaron con la nomenclatura A y B, aunque probablemente los denominara cepas. Disculpas de antemano. Actualmente los linajes que acaparan mayor atención son los B.1 y B.1.1.



LINAJES/VARIANTES

B.1.1.7:
Inglesa

B.1.351: Sudafricana

B.1.1.28: Brasileña

B.1.1.28.1/P.1: Variante de Manaos, localizada en Brasil y Japón. En este estudio se confirmó que no provenía de la original de Río de Janeiro, sino que ambas variantes surgieron y evolucionaron independientemente.

B.1.1.28.2/P.2: Localizada en Brasil, UK, USA, Argentina y Canadá



Por último, llegamos otra vez a las mutaciones, que pueden estar presentes en linajes diferentes, como hemos comprobado. No voy a repetirme y listar las que tiene cada cepa, pero dejo las importantes:

N501Y, E484K, K417N, todas de la proteína S y que hacen la tríada de las variantes brasileñas.



Y para terminar, dejo algunas páginas que considero bastante útiles para aquellos curiosos de cepas, mutaciones y demás.

Genomic epidemiology of novel cobi19 - Global subsampling

clados2.PNG

La propia Nexstratin, en la que aparecen los citados clados. La ventaja que tiene es que al clicar sobre uno (por ejemplo, el de la variante inglesa) nos muestra el linaje de cada una (las B.1.1X).

Lineage B.1.1

Página que recoge las variantes/linajes del SARS-CoV-2. Dejo el enlace a las variantes “B.1.1”, que incluyen a la inglesa como a la brasileña. Al estar todas listadas numéricamente, se me hace muy amena, una especie de pokédex coronavírica.

CoVariants: SARS-CoV-2 Mutations and Variants of Interest

Mutaciones y variantes del cobi19 de interés (podemos acceder a ella a partir de Nextstrain).

Un saludo.
 

Viernes_Negro4

Madmaxista
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Pero uno de los requisitos de la agencia brasileña del medicamento, era que las pruebas previas se realizasen en Brasil y con brasileños, no con anónimos voluntarios o en un laboratorio de north Dakota, cosa que aceptaron los chinos y los de AstraZeneca.

Veremos.
Hace tiempo que se está probando en Brasil.

Sabemos que tiene una eficacia del 50% y poco más sabemos, de la Pfizer sabemos que tiene una efectivadad del 98%, pero necesita dos dosis y, por lo que se ve, el gran hit es que atenúa los efectos ... pero no se sabe a ciencia cierta si se sigue embichando.

Igual la china inmuniza mínimo a uno de cada dos.
 

lowfour

Crackity Jones
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Bueno ya he repasado mis conocimientos de inmunología :) :

mRNA Vaccines and el bichito-19 — Deplatform Disease
[...]
Once inside the cells, mRNA is used to generate a protein- in this case a piece of the spike protein of SARS-CoV-2- and then is rapidly degraded
[...]

piece - Traducción al español – Linguee
piece traducción:

Parte, pedazo, fragmento, trozo
Alvin, muchas banderillas solo muestran un epítopo de un antígeno y tal... pero creo que en la de Pfizer y Moderna al menos presentan toda la proteína S.

el bichito-19 vaccines: How Pfizer's and Moderna's 95% effective mRNA shots work

En la página de Pfizer:

"
  • Companies advance nucleoside-modified messenger RNA (modRNA) candidate BNT162b2, which encodes an optimized SARS-CoV-2 full-length spike glycoprotein, at a 30µg dose level in a 2 dose regimen into Phase 2/3 Study"
Pfizer and BioNTech Choose Lead mRNA Vaccine Candidate Against el bichito-19 and Commence Pivotal Phase 2/3 Global Study | Pfizer
 

Averroes

Madmaxista
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Noticias fresquitas que acabo de conocer. Residencia en la provincia de Cádiz donde trabaja un familiar. Brote con 20 casos de momento justo después de vacunar a todos los residentes en estas 2 primeras semanas de Enero. No habían tenido ningún caso hasta ahora, entre otras cosas por las importantes medidas de seguridad y protocolos que han estado siguiendo siempre, y que conozco bien.
Se une así a muchas residencias que han ido siendo noticia estos últimos días. Yo no me creo que esto sea casual. Puede ser que la banderilla provoque positivos en PCR? Infecciones?
El caso además es que no están siendo "leves" o asintomáticas. Como se puede leer en esta noticia de uno de tantos casos recientes en residencias.

Preocupación por los 80 positivos del centro de mayores de Ejea
 

Brigit

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