La verdad es que no creo que te hagan mucho caso, pero bueno...

Lo primero, discrepo totalmente en lo de diversificar mucho. El 90% de los proyectos no echarían a arrancar con 100.000€, y menos en tiempos de crisis. En R&D, la masa crítica es fundamental (así como continuidad en las líneas de investigación).

Vamos a pensar en alguna idea constructiva...
-El mayor problema es que el I+D que se hace llegue a ser aplicado. El Ministerio debería tratar de fomentar más esto. Que la inversión en investigación básica no se resienta, pero que aporten más fondos para tareas en las que se aplique realmente la investigación. Ya sea buscando cadenas de proyectos (1er proyecto I+D más básica, 2º I+D más práctica, 3º aplicación en entorno real). Aquellos proyectos de aplicación en entorno real deberían tener algo más % de subvención de lo que se da normalmente, u ofrecer contrapartidas a las empresas que los hagan (en plan reducción de IRPF y cosas así). Que fomenten de verdad ese tipo de iniciativas.

-Todos los proyectos nacionales deberían tener una pequeña revisión, aunque sea muy light, para comprobar los resultados obtenidos.

-Estaría bien conocer qué entidades hacen I+D y en qué campos, por si es posible recomendar que se junten varios en algunos proyectos. Quizá es algo que ya se está haciendo con las plataformas tecnológicas, pero el Ministerio podría fomentarlo más.

-El Ministerio debería ser capaz de señalar aquellas áreas que pueden ser más prometedoras para avanzar en I+D, ayudar un poco a las empresas en cuanto a qué direcciones pueden ser buenas. No siempre lo saben todas y seguro que hay muchas que están un poco perdidas en esto de la investigación.

-Fomentar de alguna forma el trabajo de investigador. Hoy por hoy, no se valora y, muchas veces, ni merece la pena, para lo complejo que es. Hay que impulsar que las empresas contraten investigadores y que a la gente le compense investigar (aquí aplicación de reducción en el IRPF a ambos?).

No se, son algunas ideas. Y, sobre todo, no se te olvide la corbata y las historietas sobre padel y/o golf :P